Presentación
Director: Juan David Ramírez González
Categoría en Colciencias: A1
El grupo enfoca sus líneas de investigación en el desarrollo, validación e implementación de técnicas moleculares para el diagnóstico y tipificación de agentes infecciosos como Trypanosoma cruzi, Leishmania, parásitos intestinales, Clostridium difficile, Chlamydia trachomatis y Candida. Así mismo el conocimiento de la ecología molecular y diversidad genética de estos agentes para la construcción de circuitos epidemiológicos y comprender su filodinámica con el fin de proveer estrategias de control y prevención de estas enfermedades. Estos circuitos epidemiológicos son un componente importante de nuestras investigaciones ya que son sometidos a escenarios de cambio climático para conocer a fondo la ecología de las enfermedades. De igual manera, el grupo realiza análisis de filogenómica y perfiles de expresión mediante RNA-seq para entender la biología poblacional de estos microorganismos y perfiles de virulencia para responder preguntas relacionadas con interacciones patógeno/hospedero. El grupo también está interesado en conocer la genética poblacional, biología y evolución de vectores de la Enfermedad de Chagas (Rhodnius, Triatoma y Panstrongylus) y leishmaniasis
Líneas de investigación
Objetivos
Evaluar, validar e implementar técnicas de diagnóstico molecular como PCR convencional, PCR en tiempo real, LAMP y nanoparticulas para la detección de enfermedades infecciosas con el fin de fortalecer la capacidad diagnóstica de estos agentes en el país.
Diagnóstico y caracterización molecular de parásitos intestinales en menores de 15 años de una comunidad indígena del Amazonas (Colombia).
Caracterización y diagnóstico molecular de parásitos de interés en salud pública en agua cruda y tratada de cuatro plantas potabilizadoras de agua del departamento de Nariño (Colombia).
Evaluación del desempeño analítico del diagnóstico molecular de Leishmaniasis cutánea.
Comparación del diagnóstico molecular versus la colondoscopia en pacientes con infección por Clostridium difficile.
Diagnóstico molecular de Chlamydia trachomatis en pacientes infectadas con Virus del Papiloma Humano (VPH).
Diagnóstico Molecular
Objetivos
Estudiar la epidemiología molecular de infecciones del alto impacto local, nacional e internacional mediante el uso y desarrollo de técnicas moleculares de genotipificación. Estudiar la susceptibilidad y resistencia de los microorganismos a los antimicrobianos convencionales y de nueva generación mediante el uso de herramientas genómicas y transcriptómicas. Estudiar los mecanismos de virulencia y patogenicidad microbiana involucrados en las infecciones en humanos.
Proyectos:
Desarrollo de una Plataforma de MLST para la caracterización molecular de siete parásitos intestinales. Financiado por Colciencias.
Giardia and New World Leishmania phylogenomics and Disease. Financiado por PEW Charitable Trusts Foundation.
Cryptic Genetic exchange and population genomics of Giardia duodenalis.
Evaluación de la diversidad genética de Leishmania mediante Multilocus Sequence Analysis (MLSA) en Colombia.
Epidemiología molecular de Blastocystis sp en niños de edad escolar y sus mascotas caninas en Popayán, Cauca.
Aislamiento y Caracterización molecular de Clostridium difficile en Unidad de Cuidados Intensivos del Hospital Mayor Mederi.
Caracterización molecular, fenotípica y proteómica de Candida albicans nosocomial en diez hospitales de atención terciaria de Bogotá, Colombia.
Conectividad genética y grado de diferenciación en poblaciones de Rhodnius prolixus silvestres y domiciliados.
Caracterización molecular. Proteomica y fenotipica de Candida albicans nosocomial en diez hospitales de atención terciaria de Bogotá Colombia.
Epidemiología Molecular y Genómica
Objetivos
Comprender la ecología molecular y eco-epidemiología de enfermedades infecciosas mediante la aplicación de modelamiento de nicho y mapas predictivos bajo escenarios como cambio climático, con el fin de comprender la ecología de las enfermedades infecciosas más prevalentes en el país. Así mismo integrar las herramientas moleculares, estadísticas y epidemiológicas con el fin de entender la triada ecológica de las infecciones.
Proyectos:
Efecto del cambio climático en la metaciclogenesis de Trypanosoma cruzi en Rhodnius prolixus y Panstrongylus geniculatus.
Evaluación de la diversidad genética de Leishmania y modelamiento de nicho bajo escenarios de cambio climático.
Riesgo potencial de vectores secundarios de Trypanosoma cruzi bajo análisis de mapas predictivos y escenarios de cambio climático.
Factores ambientales asociados a parásitos intestinales en mujeres embarazadas estrato 1 y 2 en cuatro localidades de Bogotá.
Ecología de Enfermedades
Objetivos
Estudiar la biología, clínica y epidemiología de bacterias, virus, hongos y parásitos nativos de Colombia causante de enfermedades.
Proyectos:
Caracterización de una cohorte de pacientes con enfermedad de Chagas, su tratamiento etiológico, eventos adversos y respuesta terapéutica.
Prevalencia de Candida en infecciones nosocomiales en diez hospitales de atención terciaria de Bogotá, Colombia.
Microbiología Médica
Investigadores
Diana Caro
Estudiante de Doctorado
Angie Johana Sánchez
Estudiante de Maestría
Cielo Maritza León
Estudiante de Maestría
Claudia Marina Muñoz
Estudiante de Doctorado
Claudia Sánchez
Estudiante de Maestría
Giovanny Herrera
Joven Investigador
Lissa Cruz
Estudiante de Maestría
Luz Helena Patiño
Estudiante de Doctorado
Juan David Ramírez
Profesor Principal Director GIMUR
Dora Ines Rios Chaparro, B.Sc.
Profesora Asistente
Productos
Presentación
Presentación
Director: Juan David Ramírez González
Categoría en Colciencias: A1
El grupo enfoca sus líneas de investigación en el desarrollo, validación e implementación de técnicas moleculares para el diagnóstico y tipificación de agentes infecciosos como Trypanosoma cruzi, Leishmania, parásitos intestinales, Clostridium difficile, Chlamydia trachomatis y Candida. Así mismo el conocimiento de la ecología molecular y diversidad genética de estos agentes para la construcción de circuitos epidemiológicos y comprender su filodinámica con el fin de proveer estrategias de control y prevención de estas enfermedades. Estos circuitos epidemiológicos son un componente importante de nuestras investigaciones ya que son sometidos a escenarios de cambio climático para conocer a fondo la ecología de las enfermedades. De igual manera, el grupo realiza análisis de filogenómica y perfiles de expresión mediante RNA-seq para entender la biología poblacional de estos microorganismos y perfiles de virulencia para responder preguntas relacionadas con interacciones patógeno/hospedero. El grupo también está interesado en conocer la genética poblacional, biología y evolución de vectores de la Enfermedad de Chagas (Rhodnius, Triatoma y Panstrongylus) y leishmaniasis
Líneas de investigación
Líneas de investigación
Objetivos
Evaluar, validar e implementar técnicas de diagnóstico molecular como PCR convencional, PCR en tiempo real, LAMP y nanoparticulas para la detección de enfermedades infecciosas con el fin de fortalecer la capacidad diagnóstica de estos agentes en el país.
Diagnóstico y caracterización molecular de parásitos intestinales en menores de 15 años de una comunidad indígena del Amazonas (Colombia).
Caracterización y diagnóstico molecular de parásitos de interés en salud pública en agua cruda y tratada de cuatro plantas potabilizadoras de agua del departamento de Nariño (Colombia).
Evaluación del desempeño analítico del diagnóstico molecular de Leishmaniasis cutánea.
Comparación del diagnóstico molecular versus la colondoscopia en pacientes con infección por Clostridium difficile.
Diagnóstico molecular de Chlamydia trachomatis en pacientes infectadas con Virus del Papiloma Humano (VPH).
Diagnóstico Molecular
Objetivos
Estudiar la epidemiología molecular de infecciones del alto impacto local, nacional e internacional mediante el uso y desarrollo de técnicas moleculares de genotipificación. Estudiar la susceptibilidad y resistencia de los microorganismos a los antimicrobianos convencionales y de nueva generación mediante el uso de herramientas genómicas y transcriptómicas. Estudiar los mecanismos de virulencia y patogenicidad microbiana involucrados en las infecciones en humanos.
Proyectos:
Desarrollo de una Plataforma de MLST para la caracterización molecular de siete parásitos intestinales. Financiado por Colciencias.
Giardia and New World Leishmania phylogenomics and Disease. Financiado por PEW Charitable Trusts Foundation.
Cryptic Genetic exchange and population genomics of Giardia duodenalis.
Evaluación de la diversidad genética de Leishmania mediante Multilocus Sequence Analysis (MLSA) en Colombia.
Epidemiología molecular de Blastocystis sp en niños de edad escolar y sus mascotas caninas en Popayán, Cauca.
Aislamiento y Caracterización molecular de Clostridium difficile en Unidad de Cuidados Intensivos del Hospital Mayor Mederi.
Caracterización molecular, fenotípica y proteómica de Candida albicans nosocomial en diez hospitales de atención terciaria de Bogotá, Colombia.
Conectividad genética y grado de diferenciación en poblaciones de Rhodnius prolixus silvestres y domiciliados.
Caracterización molecular. Proteomica y fenotipica de Candida albicans nosocomial en diez hospitales de atención terciaria de Bogotá Colombia.
Epidemiología Molecular y Genómica
Objetivos
Comprender la ecología molecular y eco-epidemiología de enfermedades infecciosas mediante la aplicación de modelamiento de nicho y mapas predictivos bajo escenarios como cambio climático, con el fin de comprender la ecología de las enfermedades infecciosas más prevalentes en el país. Así mismo integrar las herramientas moleculares, estadísticas y epidemiológicas con el fin de entender la triada ecológica de las infecciones.
Proyectos:
Efecto del cambio climático en la metaciclogenesis de Trypanosoma cruzi en Rhodnius prolixus y Panstrongylus geniculatus.
Evaluación de la diversidad genética de Leishmania y modelamiento de nicho bajo escenarios de cambio climático.
Riesgo potencial de vectores secundarios de Trypanosoma cruzi bajo análisis de mapas predictivos y escenarios de cambio climático.
Factores ambientales asociados a parásitos intestinales en mujeres embarazadas estrato 1 y 2 en cuatro localidades de Bogotá.
Ecología de Enfermedades
Objetivos
Estudiar la biología, clínica y epidemiología de bacterias, virus, hongos y parásitos nativos de Colombia causante de enfermedades.
Proyectos:
Caracterización de una cohorte de pacientes con enfermedad de Chagas, su tratamiento etiológico, eventos adversos y respuesta terapéutica.
Prevalencia de Candida en infecciones nosocomiales en diez hospitales de atención terciaria de Bogotá, Colombia.
Microbiología Médica
Investigadores
Investigadores
Diana Caro
Estudiante de Doctorado
Angie Johana Sánchez
Estudiante de Maestría
Cielo Maritza León
Estudiante de Maestría
Claudia Marina Muñoz
Estudiante de Doctorado
Claudia Sánchez
Estudiante de Maestría
Giovanny Herrera
Joven Investigador
Lissa Cruz
Estudiante de Maestría
Luz Helena Patiño
Estudiante de Doctorado
Juan David Ramírez
Profesor Principal Director GIMUR
Dora Ines Rios Chaparro, B.Sc.
Profesora Asistente