Genómica de la biodiversidad
El objetivo del curso es proporcionar a los estudiantes una introducción al conocimiento teórico y práctico para los análisis evolutivos utilizando datos de secuenciación de próxima generación (NGS). Durante el curso de genómica de la biodiversidad se trabajará el análisis y ensamblaje de datos genómicos, técnicas de alineamiento de secuencias, llamadas de variantes, prueba de hipótesis, identificación de procesos de selección, hibridación e introgresión, análisis de demografía y análisis filogenómicos. El curso se presentará como una serie de clases teóricas cortas, seguido de ejercicios individuales y en grupos pequeños en el computador donde los estudiantes tendrán la oportunidad de analizar datos genómicos empíricos durante un período de una semana en noviembre/diciembre de 2021. Además, tres invitados internacionales presentarán seminarios sobre la utilidad de los datos genómicos en sus investigaciones. Al final del curso los estudiantes recibirán un certificado de participación dependiendo de la asistencia y la finalización exitosa de las actividades propuestas.
Organizan
Dirigido a
Estudiantes de pregrado y posgrado de América Latina con conocimiento básico en genética y biología molecular que quieran aprender una introducción a los pasos necesarios en el análisis de datos genómicos.
Objetivos
Ofrecer un curso para que estudiantes locales y latinoamericanos tengan la oportunidad de aprender a analizar datos genómicos con un enfoque a nivel de poblaciones o de especies estrechamente relacionadas, con el fin de comprender los procesos evolutivos que generan la gran biodiversidad que observamos en la región Neotropical.
(4.1) Desarrollar conocimientos básicos de bioinformática, línea de comando y análisis en clusters de cómputo
(4.2) comprender los diferentes tipos de secuenciación y los pasos principales para analizar los datos derivados de ellos.
(4.3) familiarizar a los estudiantes con el uso de herramientas para manipular datos genómicos.
(4.4) introducción al análisis de genética de poblaciones, incluidos análisis demográficos y análisis de selección e introgresión.
(4.5) demostrar la utilidad de los análisis genómicos en la investigación a través de seminarios de investigadores internacionales..
Metodología
El contenido del curso se desarrollará a través de un enfoque activo mediante del uso de metodologías de “live-coding” y resolución de problemas. El material utilizado para el análisis son genomas de organismos presentes en América del Sur, con enfoque en Colombia. Basado en datos empíricos, los estudiantes desarrollarán tareas cortas (individuales, en parejas o grupos pequeños) con el objetivo de consolidar lo aprendido durante las demostraciones de los instructores. Las tareas desarrolladas por los estudiantes serán compartidas con los instructores y monitores para que estos puedan verificar cómo los estudiantes están desarrollando satisfactoriamente las actividades. De esta forma se pueden identificar y aclarar dificultades que los estudiantes tengan durante el desarrollo del curso; además, pendiente de la finalización satisfactoria de las actividades practicas, los estudiantes recibirán un certificado de participación.
Beneficios
Los datos genómicos se utilizan cada vez más para comprender los procesos que llevaron a la diversificación de grupos de organismos en la región Neotropical. La enorme diversidad biológica observada en las regiones tropicales, en particular en la región tropical de América, implica un reto para los estudios de evolución y genética ya que muchos de los organismos que encontramos en la región no pueden analizarse usando los recursos disponibles para organismos modelo, como humanos y ratones. El principal beneficio de este curso es que el alumno desarrollará las habilidades para poder realizar todos los pasos necesarios para el análisis de datos genómicos; desde recibir los datos y limpiarlos hasta generar resultados sobre los procesos y analizando los patrones genéticos observados. Además, los estudiantes tendrán la oportunidad de aprender técnicas para analizar datos de organismos modelo y no modelo usando herramientas computacionales. En ese sentido las actividades de los días 2 a 5 del curso serán relevantes tanto en el contexto local (Colombia) como en el contexto regional (América Latina). Además, este curso será principalmente en español, lo que ayudará a los estudiantes latinoamericanos a obtener acceso a instrucciones paso a paso en su idioma nativo.
Conferencistas
Horario
Fechas: Del 22 de noviembre al 26 de noviembre de 2021
Horario: De 9:00 a.m. a 5:00 p.m. de acuerdo al cronograma de cada módulo.
Lugar: Acceso Remoto
Intensidad: 32 horas
Tipo de Oferta: Curso.
Créditos y materias a homologar: Genómica de la biodiversidad: curso electivo de pregrado de la Facultad de Ciencias Naturales (2 créditos).
Idioma: Español e inglés. El curso se dicta en español. Las charlas de dos de los tres conferencistas serán en inglés.
Organiza: Facultad de Ciencias Naturales
Inversión: $200.000 – 56 USD (aprox.)
Descuentos:
10% Comunidad Rosarista
10% Comunidad Internacional
10% Acceso Remoto (aplica para todos los participantes, ya que el curso será dictado 100% en esta modalidad)
10% Pronto pago antes del 7 de noviembre, 2021 (aplica para todos los participantes que realicen su inscripción antes de la fecha indicada)
Nota: En caso de que los participantes deseen homologar este curso en su plan de estudios (si aplica), deberán informarlo al Asesor Comercial para conocer el proceso de inscripción.
Requisitos:
- Computador con acceso a internet. Si el estudiante es de la Universidad del Rosario debe haber tomado el curso de Biología Molecular (Semestre IV). Para estudiantes externos, se recomienda conocimiento básico de genética y biología molecular.
Introducción a la bioinformática
22/11/21
Conferencistas:
Juan Enciso y Andréa Tonolli (ESP)
Formatos de datos secuenciación y procesamiento de datos
23/11/21
Conferencista:
Juan Enciso y Andréa Tonolli (ESP)
Joana Meier (ING)
Preparación de datos para análisis
24/11/21
Conferencista:
Juan Enciso y Andréa Tonolli (ESP)
Javier Tabima (ESP)
Genética de poblaciones I
25/11/21
Conferencista:
Juan Enciso y Andréa Tonolli (ESP)
Tom Booker (ING)
Genética de poblaciones II
26/11/21
Conferencista:
Juan Enciso y Andréa Tonolli (ESP)