El Dr. Fernando ha investigado los humedales para cuantificar los procesos de la superficie del agua y la conectividad hidrológica bajo la vegetación. Estas superficies son unas de las menos investigadas en las ciencias hidrológicas, ya que son difíciles de detectar desde el espacio. 

Fernando utiliza la teledetección, la hidrogeodesia y en combinación con la inteligencia artificial para dicha evaluación. Por ejemplo, su grupo ha desarrollado ahora una rutina para identificar barreras hidrológicas en grandes humedales de Colombia y el mundo. Esta rutina se basa en una serie de aplicaciones de InSAR en humedales y lagos de todo el mundo para evaluar los cambios espaciales y temporales de la superficie del agua.

Su grupo ha desarrollado recientemente el modelo DeepAqua, que utiliza redes neuronales convolucionales para identificar la extensión combinada de la superficie del agua de aguas abiertas y zonas con vegetación inundada. El modelo es la primera aplicación de IA para teledetección que no necesita datos anotados para sus predicciones. Recientemente, junto con colaboradores de la Universidad del Rosario.

El Dr. Fernando ha desarrollado un estudio global hidro climático de ecosistemas tipo páramo a escala global para entender como estos se verán afectados en el futuro.